ועדות המועצה הן המסגרות שבהן ממקדת המועצה את עבודתה.

מדובר בפורום ציבורי-מקצועי המשלב בין נבחרי הציבור, חברי ההנהלה והדרגים המקצועיים הבכירים של הרשות.
במסגרת הוועדות נשמעות עמדות מומחים ויועצים, נדונים נושאים מהותיים ומתקבלות החלטות בתחומים שונים.

במועצה אזורית מבואות החרמון  פועלות הוועדות הבאות: